Al igual que con otros AINEs el Meloxicam puede presentar como efectos colaterales iniciales síntomas gastrointestinales, por lo general son los más frecuentes, dispepsia, náusea, diarrea, dolor abdominal, vómito, constipación y flatulencias. A nivel de piel, se puede presentar rash cutáneo y prurito. Se han reportado casos de cefaleas y mareos.
En casos raros, con incidencias menores al 1% anorexia, aumento del apetito, sequedad bucal, estomatitis, enfermedad ácido péptica, además de migraña, estupor, vértigo, depresión e insomnio.
Se han reportado informes aislados de reacciones por la administración parenteral a largo plazo de tiamina y vitamina B6 y B12 lo que puede deberse a casos raros de hipersensibilidad. Además de trastornos gastrointestinales como náuseas, vómitos, diarrea, dispepsia, flatulencia y anorexia. En raras ocasiones hemorragia intestinal, melena, hematemesis, ulceración y perforación.
A nivel del Sistema Nervioso Central se puede observar vértigo cefalea, y muy rara vez parestesias, trastornos de la sensibilidad y de la visión.
En piel en casos aislados se ha documentado: erupciones vesiculares, eccema, eritema multiforme, síndrome de Steven-Johnson. A nivel renal muy rara vez se ha presentado: hematuria, proteinuria, insuficiencia renal aguda, y a nivel hepático existen reportes de la actividad de aminotransferasas y hepatitis con o sin ictericia.