Se han observado trastornos gastrointestinales como náuseas, vómito, malestar epigástrico, flatulencia y diarrea en algunos pacientes que reciben dicloxacilina. Se ha reportado colitis pseudomembranosa con el uso de la dicloxacilina. Por tanto es importante considerar el diagnóstico en pacientes que desarrollan diarrea en asociación con el uso de dicloxacilina. El tratamiento con antibióticos altera la flora normal del colon y puede favorecer el desarrollo del Clostridium difficile. Se ha demostrado que las resinas colestiramina y colestipol se unen a las toxinas de Clostridium in vitro. Estas resinas de intercambio reducen el peristaltismo y los síntomas sistémicos en pacientes con colitis pseudomembranosa. Lolcasos leves de colitis pueden responder al discontinuar el medicamento, los casos moderados deben tratarse con líquidos, electrólitos y complementos proteínicos. Para, los casos graves el medicamento de elección es la vancomicina. Por otro lado, ocasionalmente se presentan prurito, urticaria, exantemas cutáneos y síntomas alérgicos, al igual que con toda las penicilinas. Hay pacientes el tratamiento presentan eosinofilia, con o sin manifestaciones alérgica.